本系自然地理学科的前身为衡阳师范专科学校地理系自然地理教研室，始建于1984年。1999年升为本科院校之后，在大力加强人才队伍建设和科研条件建设的基础上，本学科成员围绕自然地理学研究热点，结合当地区域发展和生态环境建设实际，积极开展了土地资源、水资源、气候资源、旅游资源等基础研究，初步形成了以湘南资源环境管理研究为基础、以灾害研究与生态恢复为重点的学术群体。2002年本院成立了以自然地理学科为核心的 “区域发展与生态安全研究中心”；2003年自然地理学科被确定为我院九个首批重点建设学科之一，2007年经验收合格转为院级重点学科，2010年以考核优秀结论获得院级重点学科建设项目验收。

本院级重点学科以田亚平教授为学科带头人，团队成员包括王鹏、刘兰芳、邹君、钟顺清、郑文武、邓育武、邓美容等。多年来，本学科团队以湘南研究为重点，以密切结合地方资源环境与社会经济实际的综合性、区域性和应用性研究为特色，逐渐形成了区域生态环境评估与自然灾害综合防御研究和区域资源管理与可持续发展战略研究等两个稳定的学科方向。2007年-2010年建设期间，学科成员主持承担各类科研项目项目37项，其中新增项目27项，完成结题项目16项。其中主持省部级以上科研教研项目24项，包括新增省部级以上科研教研项目18项，其中国家自然科学基金项目1项，教育部人文社科项目1项，湖南省自然科学基金项目3项，湖南省社会科学基金项目2项，湖南省科技厅计划项目2项，新增主持各类横向课题6项，新增科研项目经费335.5万元，其中纵向科研项目进校经费74.8万元，横向课题进校经费239万元。2007年以来发表论文69篇，其中一级学报论文3篇，核心以上期刊论文40篇，出版专著2部；主持或参与获得各类科研成果奖9项，其中包括参与获得湖南省科技进步二等奖1项（排名第9）、湖南省教育科学十五规划课题研究优秀成果一等奖1项（排名第4），主持获得湖南省第二次农业普查课题成果一等奖1项，衡阳市优秀社科成果奖6项，院科研成果奖5项。